A negociação de debêntures em mercado de balcão foi simplificada com a criação, em junho de 1998, do Sistema Nacional de Debêntures (SND), com o objetivo de registrar a emissão, permitir a negociação, custódia e a liquidação financeira de operações realizadas com debêntures no mercado de balcão brasileiro.

As debêntures são vendidas pela cotação a partir do Preço Unitário (PU) da curva do papel no dia da compra.

Esse preço é calculado e repassado pelo agente fiduciário à instituição vendedora e pode variar de acordo com a remuneração do título.

Tanto o preço da debênture como a posição de cada debenturista podem ser acompanhados diariamente pela Internet, caso a instituição ofereça essa facilidade.

Os negócios podem ser intermediados pelas instituições financeiras como bancos de investimentos, bancos múltiplos com carteira de investimento, sociedades corretoras, sociedades distribuidoras e agentes autônomos credenciados por essas instituições.